| 1 | Sekretariat Jenderal | http://setjen.pertanian.go.id/ |
| 2 | Inspektorat Jenderal | http://itjen.pertanian.go.id/ |
| 3 | Direktorat Jenderal Tanaman Pangan | http://tanamanpangan.pertanian.go.id/ |
| 4 | Direktorat Jenderal Hortikultura | http://hortikultura.pertanian.go.id/ |
| 5 | Direktorat Jenderal Peternakan dan Kesehatan Hewan | http://ditjennak.pertanian.go.id/ |
| 6 | Direktorat Jenderal Perkebunan | http://ditjenbun.pertanian.go.id/ |
| 7 | Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian | http://www.litbang.pertanian.go.id/ |
| 8 | Badan Ketahanan Pangan | http://bkp.pertanian.go.id/ |
| 9 | Direktorat Jenderal Prasarana dan Sarana Pertanian | http://psp.pertanian.go.id/ |
| 10 | Badan Karantina Pertanian | http://karantina.pertanian.go.id/ |
| 11 | Badan Penyuluhan dan Pengembangan Sumberdaya Manusia Pertanian | http://bppsdmp.pertanian.go.id// |